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Dank NVIDIA-Tesla-GPUs durchbricht neuer Gen-Sequenzer die 1.000-Dollar-Preismarke

Das Ion Proton System von Life Technologies macht Genomsequenzanalyse für Wissenschaftler und medizinische Forscher weltweit zugänglicher.

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NVIDIA
Susanna Tatár
statar@nvidia.com


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Life Technologies Ion Proton Sequencer – Beschleunigt von NVIDIA-Tesla-GPUs (Bildrechte liegen bei Life Technologies)
Life Technologies Ion Proton Sequencer – Beschleunigt von NVIDIA-Tesla-GPUs (Bildrechte liegen bei Life Technologies)

Santa Clara, Kalifornien, 31. Oktober 2012 – NVIDIA-Tesla-GPU-Beschleunigung ermöglicht dem neuen Ion Proton System der Life Technologies Corporation, die primäre Genom-Sequenzanalyse, also die Berechnung von der DNA-Basenpaaren, um über das 16-fache zu beschleunigen. Die Kosten für eine Sequenzanalyse eines gesamten menschlichen Genoms betrugen vor zehn Jahren etwa 1 Milliarde Dollar. In naher Zukunft können diese dank GPU-Unterstützung auf bis zu 1.000 Dollar gesenkt werden.

Lesen Sie mehr dazu in unten stehender englischer Pressemitteilung.

 

New Gene Sequencer to Break $1,000 Cost Barrier
with NVIDIA Tesla GPU Acceleration

Ion Proton System From Life Technologies Makes Genome-Scale Sequencing
More Accessible to Scientists and Medical Researchers Worldwide

 

SANTA CLARA, Calif.—Oct. 31, 2012—NVIDIA® Tesla® GPU accelerators are enabling Life Technologies Corporation’s new Ion Proton™ System to accelerate primary genome-sequence analysis – the computation that generates DNA base pairs – by over 16 times. This will dramatically reduce the cost to sequence an entire human genome from about $1 billion a decade ago to $1,000 in the near future.

“GPU acceleration and other advanced Ion Proton features enable every laboratory in the world to take advantage of human genome sequencing quickly and easily, without costly IT investments,” said Alan Williams, vice president of software and engineering in the Ion Torrent unit at Life Technologies Corporation. “By democratizing genome sequencing, we expect to see an unprecedented wave of innovation in life sciences and the advancement of clinical research.”

The Ion Proton System’s technology builds on the rapid advances in increasing throughput, accuracy and read-length achieved with the Life Technologies Ion Personal Genome Machine® (PGM™) Sequencer, which also uses GPUs to accelerate primary analysis. The Ion PGM sequencer was the first to decode the deadly 2011 E. coli bacteria outbreak in Germany because of its exceptional speed.

Setting new standards for performance, ease of use and affordability, the Ion Proton System enables researchers to rapidly go from multiplex sample sequencing to genome-scale sequencing on a single platform. At one-fifth the cost of light-based genome-scale sequencing systems, it can save researchers hundreds of thousands of dollars.

“GPU acceleration has become pervasive in all aspects of computing for life science applications and will enable research to push the envelope of scientific discovery,” said Sumit Gupta, general manager of the Tesla accelerated computing business unit at NVIDIA. “The pace of research has fundamentally been accelerated by the use of GPUs for everything from gene sequencers and sequence analysis to molecular modeling and diagnostic imaging.”

About NVIDIA Tesla GPUs
NVIDIA Tesla GPUs are massively parallel accelerators based on the NVIDIA CUDA® parallel computing platform and programming model. Tesla GPUs are designed from the ground up for power-efficient, high performance computing, computational science, and supercomputing, delivering dramatically higher application acceleration for a range of scientific and commercial applications than a CPU-only approach.

More information about NVIDIA Tesla GPUs is available at the Tesla website. To learn more about CUDA or download the latest version, visit the CUDA website. More NVIDIA news, company and product information, videos, images and other information is available at the NVIDIA newsroom. Follow us on Twitter at @NVIDIATesla.

Über NVIDIA
NVIDIA (NASDAQ: NVDA) hat durch die Erfindung des Grafikprozessors (GPU) im Jahr 1999 die Computergrafik revolutioniert. Heute setzt eine Vielzahl von Produkten auf NVIDIA-Prozessoren wie Smartphones bis hin zu Supercomputern. NVIDIAs Mobilprozessoren kommen in Mobiltelefonen, Tablets und Infotainment-Systemen im Automobilbereich zum Einsatz.  PC-Gamer schwören auf NVIDIA-GPUs, die für spektakuläre Spielewelten sorgen. Professionelle Anwender entwerfen mit ihrer Hilfe 3D-Grafiklösungen und visuelle Effekte für die Filmindustrie und Produkte wie Fahrzeuge, Gebäude oder komplette Landschaften. Darüber hinaus nutzen Forscher High-Performance-Computer mit NVIDIA-GPUs, um in der Wissenschaft neue Meilensteine zu setzen. Das Unternehmen hält weltweit über 5.000 Patente. Weitere Informationen finden Sie unter www.nvidia.de.